Да, расчет деформаций с учетом состояния с трещинами в сечении включен в расчет бетона в RFEM 6.
Для этого эффективная жесткость рассчитывается для каждого элемента в расчёте бетона в соответствии с существующим состоянием сечения с трещинами (состояние II) или без трещин (состояние I), а затем используется во втором расчете по МКЭ - для деформации.
В программе RFEM 5 это соответствует решению в дополнительном модуле «RF-CONCRETE Deflect». В RFEM 6 этот метод включен в расчёт железобетонных конструкций.
Более подробная информация об определении состояния трещин в рамках расчета деформаций затем содержится в технической статье, находящейся по данной ссылке.