Dwa przylegające do siebie pręty mogą zostać połączone ("stopione") w jeden pręt. Ta opcja jest dostępna w funkcji Usuń węzeł menu kontekstowego węzła', które można wywołać, klikając węzeł współdzielony prawym przyciskiem myszy.
Usuwanie za pomocą klawisza Usuń odpowiada pierwszej opcji, w której usuwany jest wybrany węzeł, a tym samym połączone pręty. Opcja Scal połączone pręty powoduje usunięcie węzła i scalenie dwóch prętów. Ta opcja jest dostępna dla węzłów, które są połączone z dokładnie dwoma prętami.